U drugo kolo završnice seniorskog Kupa Federacije BiH plasirali su se: FK „Budućnost“ Banovići, NK „Kiseljak“, FK „Bosna Union“ Sarajevo, FK „Famos“ Hrasnica, NK „Mladost“ Kikači, FK „Klis“ Buturović Polje, NK „Moševac“ i NK „Pobjeda“ Tešanjka

Pored navedenih klubova u drugom kolu seniorskog Kupa Federacije BiH još igraju klubovi koji nastupaju u Prvoj ligi FBiH: NK „Bosna“ Visoko, NK „Bratstvo“ Gračanica, HNK „Čapljina“, FK „Goražde“, FK „Igman“ Konjic, NK „Jedinstvo“ Bihać, NK „Metalleghe BSI“ Jajce, NK „Novi Travnik“, FK „Olimpik“ Sarajevo, HNK „Orašje“, FK „Rudar“ Kakanj, NK „Slaven“ Živinice, NK „Tošk“ Tešanj, FK „Velež“ Mostar, NK „Vitez“ i NK „Zvijezda“ Gradačac.

I u ovoj fazi takmičenja igra se samo jedna utakmica,a pobjednik će se plasirati u 1/16 finala kupa BiH.